More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2161 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  38.57 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  43.22 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  40.44 
 
 		 144 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 144 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 144 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  38.97 
 
 		 144 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  40.14 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 145 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 145 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 144 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 142 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 		 147 aa  88.2  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 		 147 aa  88.2  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 146 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 141 aa  85.5  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 141 aa  85.5  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 145 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 146 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  35.71 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  32.87 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  32.87 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  32.87 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  33.8 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  32.87 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  32.87 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  32.85 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  32.85 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  32.85 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  35.25 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  34.53 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  33.82 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  35.54 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  35.54 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  34.43 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  35.54 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  35.54 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  35.54 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 138 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  33.61 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  38.61 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  31.97 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  34.43 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  34.43 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  35.09 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  34.21 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  32.59 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  26.67 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>