More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0135 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  314  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  60.31 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  56.52 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  51.13 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 202 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  48.2 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 142 aa  120  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  47.83 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  51.94 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5463  MarR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0475431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  44.53 
 
 		 210 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 159 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  40.74 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  40.65 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 151 aa  84  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 145 aa  84  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  39.1 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  35.21 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2319  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  35.97 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  35.14 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  31.45 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  31.53 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  33.64 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  31.45 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  29.37 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  31.45 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  31.45 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  32.26 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  32.26 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  32.26 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>