More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3000 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
145 aa  286  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  87.41 
 
 
146 aa  250  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  86.71 
 
 
145 aa  246  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
165 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2319  MarR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
160 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
150 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
150 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
159 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  41.09 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
150 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 
176 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
202 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
158 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 
158 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  35.56 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  39.2 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  41.82 
 
 
210 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  33.85 
 
 
150 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
156 aa  76.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5463  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0475431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  37.6 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  31.11 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 
149 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
171 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  32.2 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.83 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  34.11 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  37.8 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  29.91 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
160 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>