More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1107 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  282  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  91.03 
 
 		 191 aa  258  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  81.38 
 
 		 177 aa  221  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 153 aa  86.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  36.3 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  36.36 
 
 		 144 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  33.63 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  37.78 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  34.51 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  32.54 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 157 aa  67  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  31.82 
 
 		 143 aa  66.6  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  31.82 
 
 		 143 aa  66.6  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  31.82 
 
 		 143 aa  66.6  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  35.65 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  31.78 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  31.78 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  31.78 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  31.78 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  31.78 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  31.78 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  31.75 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  31.78 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  30.6 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35.19 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  30.09 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  33.04 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  30.66 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  33.04 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>