More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1634 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
140 aa  285  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  58.27 
 
 
161 aa  175  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 
149 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
137 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  52.24 
 
 
142 aa  144  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  52.24 
 
 
142 aa  144  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
138 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
172 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
157 aa  84.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
176 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
169 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  34.85 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  43.68 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29.2 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  35.51 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  35.43 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
172 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.6 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  32.82 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  40.22 
 
 
157 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  40.22 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  30.23 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
201 aa  70.5  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
165 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  34.58 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  35 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>