More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1249 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 155 aa  304  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  84.52 
 
 		 154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 180 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  40.65 
 
 		 140 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 174 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 158 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 158 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 172 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  39.37 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 315 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.93 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  27.46 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  18.8 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  18.8 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>