270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2817 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
150 aa  288  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  76.67 
 
 
150 aa  230  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  61.19 
 
 
150 aa  167  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  61.19 
 
 
150 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  64.39 
 
 
150 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  64.49 
 
 
150 aa  156  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
159 aa  154  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  57.05 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  60.45 
 
 
156 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  60.29 
 
 
150 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  60.45 
 
 
162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  60.45 
 
 
162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  60.45 
 
 
162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
151 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
151 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
151 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
151 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
151 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
147 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
151 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  46.96 
 
 
175 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  43.07 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  39.1 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
161 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  43.41 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  44.74 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  38.97 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  39.85 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  37.27 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  41.79 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
307 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  36.79 
 
 
163 aa  57  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
151 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
157 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>