188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4190 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  283  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  40.46 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  41.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  42.52 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  42.34 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  41.32 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  40.6 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  38.18 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  37.61 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  41.49 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  33.55 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 162 aa  57  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1242  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  32.32 
 
 		 141 aa  50.8  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  40.28 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  31.43 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 171 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 171 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>