217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3541 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  100 
 
 		 155 aa  307  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  63.38 
 
 		 161 aa  192  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  59.85 
 
 		 168 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6619  MarR family transcriptional regulator  61.43 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2306  transcriptional regulator, TrmB  57.04 
 
 		 141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  43.93 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  38.66 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0585  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  36.79 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  35.63 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  31.09 
 
 		 177 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  22.95 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  22.95 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  21.36 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  22.95 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  22.95 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30.84 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  33.71 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  24.35 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 207 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  21.8 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  21.62 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  51.22 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>