More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0728 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 142 aa  279  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1242  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  42.48 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  38.69 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  43.27 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  37.86 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  33.98 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  34.91 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 324 aa  48.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>