141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0154 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
324 aa  658    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  53.11 
 
 
323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.6 
 
 
316 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.25 
 
 
314 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.35 
 
 
319 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  29.62 
 
 
345 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.73 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  28.62 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  40.41 
 
 
166 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 
162 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09031  transcriptional regulator, MarR family protein  37.5 
 
 
151 aa  105  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  43.09 
 
 
184 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  38.26 
 
 
160 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  32.34 
 
 
168 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.473125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.97 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
334 aa  67  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.92 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.95 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  26.3 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  26.17 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  24.4 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4590  transcriptional regulator, MarR family  24.49 
 
 
156 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220277  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2864  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
188 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
141 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
340 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
143 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
291 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
326 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
340 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 
161 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  28.78 
 
 
161 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  24.68 
 
 
161 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  44.87 
 
 
172 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
161 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  34.85 
 
 
166 aa  49.3  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  21.76 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  21.76 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
138 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
150 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.18 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
144 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  43.59 
 
 
167 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  43.59 
 
 
167 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  43.59 
 
 
167 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  43.59 
 
 
167 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  43.59 
 
 
167 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.98 
 
 
291 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
167 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
143 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1342  acetyltransferase  30.91 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0732306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 
159 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
143 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
143 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  40.58 
 
 
219 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  30.08 
 
 
160 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
164 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  28.19 
 
 
146 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  25.69 
 
 
290 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 
157 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.91 
 
 
141 aa  46.6  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
158 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  25.28 
 
 
329 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
155 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
152 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 
158 aa  46.2  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  38.46 
 
 
161 aa  46.2  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  39.74 
 
 
167 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
167 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  37.66 
 
 
151 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  26.69 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  35.79 
 
 
173 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0540  transcriptional regulator  33.82 
 
 
140 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20796  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
145 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  39.74 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  35.06 
 
 
146 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
208 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
167 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  39.74 
 
 
167 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
173 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
140 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  43.59 
 
 
167 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4797  acetyltransferase, gnat family  35.11 
 
 
163 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 
141 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 
161 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1153  acetyltransferase domain-containing protein  29.09 
 
 
264 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2290  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
146 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000698981  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2332  regulatory protein MarR  33.9 
 
 
146 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
150 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  41.03 
 
 
167 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 
151 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>