262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3178 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 173 aa  359  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  70.52 
 
 		 170 aa  249  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  66.03 
 
 		 312 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  62.82 
 
 		 313 aa  209  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  64.33 
 
 		 320 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  63.22 
 
 		 309 aa  208  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 347 aa  207  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  62.75 
 
 		 349 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 349 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  67.52 
 
 		 340 aa  204  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  64.74 
 
 		 347 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 334 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 322 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  53.89 
 
 		 352 aa  189  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 340 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 326 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  57.32 
 
 		 283 aa  184  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  56.41 
 
 		 301 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  55.9 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  52.98 
 
 		 167 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  55.28 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  55.06 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  54.17 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  53.16 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  53.16 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  53.16 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  52.53 
 
 		 167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 326 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  53.61 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  53.61 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  53.61 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  53.61 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  55.7 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  53.01 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  56.52 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  55.9 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  55.9 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  55.9 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  55.9 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  55.9 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  51.88 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 307 aa  141  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  38.89 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  40.13 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  38.22 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  37.34 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  31.48 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 		 160 aa  94  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 		 161 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  36.08 
 
 		 162 aa  90.9  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  35 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  32.09 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1922  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.56 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  32.12 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.47 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  28.66 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.04 
 
 		 320 aa  57.8  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.8 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  31.13 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  30.91 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.07 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 314 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.04 
 
 		 326 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4514  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.19 
 
 		 310 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  30.28 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  31.15 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 		 305 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3450  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 		 306 aa  52  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 345 aa  51.6  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2090  phosphinothricin acetyltransferase, putative  30.85 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 307 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  42.86 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0598  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>