280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2042 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
170 aa  348  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  40.71 
 
 
163 aa  97.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  39.1 
 
 
169 aa  87.8  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
189 aa  87.4  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
162 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 
196 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1699  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4319  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3859  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  30.57 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1535  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4192  GCN5-related N-acetyltransferase  35.34 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658468  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3907  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5878  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703036  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3939  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
188 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4427  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
188 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.59 
 
 
289 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0403  putative acetyltransferase  30.22 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7207  acetyltransferase  30.5 
 
 
208 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0387  putative acetyltransferase  28.95 
 
 
182 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47745  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
156 aa  61.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00551848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4359  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 
208 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1692  acetyltransferase  33.04 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6850  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0741  acetyltransferase  33.04 
 
 
245 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  36.27 
 
 
149 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1679  acetyltransferase  33.04 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1887  acetyltransferase  33.04 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0559  acetyltransferase  33.04 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2409  acetyltransferase  33.04 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2270  acetyltransferase  33.04 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.811182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2492  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4352  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
183 aa  57.4  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2929  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0333345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  31.79 
 
 
380 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  34.45 
 
 
387 aa  55.1  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  37.36 
 
 
322 aa  54.7  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  34.48 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  31.3 
 
 
407 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1186  GCN5-related N-acetyltransferase  32.85 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
155 aa  54.3  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2152  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 
184 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2428  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
178 aa  54.3  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  34.95 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5914  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3636  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5563  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34680  acetyltransferase (GNAT) family protein  25.64 
 
 
200 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10134  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.762819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
173 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 
167 aa  52  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  28.78 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0418  acetyltransferase  28.48 
 
 
184 aa  51.2  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0657723 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
170 aa  51.6  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  34.71 
 
 
160 aa  51.2  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
173 aa  51.2  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  30.17 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
1147 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0639273  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  28.06 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  26.9 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0406  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24460  acetyltransferase  30.33 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2994  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0331323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
340 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3645  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0611  acetyltransferase  28.36 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5129  GCN5-related N-acetyltransferase  33.62 
 
 
175 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601206  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4605  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 
175 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0870  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0265  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
160 aa  47.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>