240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0291 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  61.64 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 305 aa  255  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  45.89 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42.33 
 
 		 304 aa  242  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  44.44 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 309 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.89 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 315 aa  228  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.78 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.41 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  37.63 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.57 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.73 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  43.67 
 
 		 162 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.41 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  37.34 
 
 		 163 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 143 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 		 161 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  32.47 
 
 		 161 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 		 161 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.82 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.43 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.73 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.94 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.53 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.16 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  24.1 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  26.24 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.9 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  22.77 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 142 aa  65.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  25.09 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 163 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 150 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  31.33 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  25.8 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  20.65 
 
 		 848 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  20.41 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 157 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 157 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 155 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 157 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 154 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3801  GCN5-related N-acetyltransferase  24.43 
 
 		 172 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.54281  decreased coverage  0.000138892 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 		 162 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  30.86 
 
 		 160 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  20.56 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 		 173 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 163 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  21.32 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 168 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>