280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0755 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
170 aa  352  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  70.52 
 
 
173 aa  249  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  66.03 
 
 
313 aa  216  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  62.82 
 
 
322 aa  206  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  62.42 
 
 
320 aa  201  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  61.54 
 
 
349 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  58.6 
 
 
283 aa  198  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  63.46 
 
 
312 aa  198  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  61.54 
 
 
347 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  61.54 
 
 
349 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  66.24 
 
 
309 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  66.24 
 
 
340 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  63.46 
 
 
347 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  58.17 
 
 
301 aa  192  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
352 aa  188  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  64.97 
 
 
340 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  57.76 
 
 
167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  64.97 
 
 
326 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  57.14 
 
 
167 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  55.77 
 
 
334 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  53.25 
 
 
167 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  54.55 
 
 
167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  54.19 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
326 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  51.61 
 
 
167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  51.61 
 
 
167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  51.61 
 
 
167 aa  164  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  56.02 
 
 
167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  56.02 
 
 
167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  56.02 
 
 
167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  56.02 
 
 
167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  55.42 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  51.61 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  58.39 
 
 
167 aa  158  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  57.76 
 
 
167 aa  158  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  57.76 
 
 
167 aa  158  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  57.76 
 
 
167 aa  158  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  57.76 
 
 
167 aa  157  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  57.76 
 
 
167 aa  157  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  53.75 
 
 
172 aa  153  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  50.63 
 
 
167 aa  147  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
307 aa  140  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  38.22 
 
 
161 aa  121  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  35.44 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 
161 aa  107  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  37.74 
 
 
163 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  33.12 
 
 
164 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  39.42 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  33.75 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  31.85 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1922  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.17 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641628  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 
163 aa  61.6  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
189 aa  60.8  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4514  GCN5-related N-acetyltransferase  30.15 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  37.35 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  31.25 
 
 
387 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  34.18 
 
 
238 aa  57  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
309 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0441  acetyltransferase, gnat family  30.6 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4819  acetyltransferase, gnat family  28.68 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.866921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4824  acetyltransferase  28.68 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
310 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.77 
 
 
316 aa  55.1  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
314 aa  54.7  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  40.91 
 
 
322 aa  54.3  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4797  acetyltransferase, gnat family  28.47 
 
 
163 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
316 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0598  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408696  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  36.79 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
306 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
309 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
166 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
160 aa  52  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.88 
 
 
319 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.17 
 
 
312 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
163 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  31.13 
 
 
161 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
170 aa  51.6  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
305 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  31.01 
 
 
380 aa  51.2  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
168 aa  50.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>