More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4736 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
167 aa  347  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  100 
 
 
167 aa  347  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  99.4 
 
 
167 aa  345  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  97.6 
 
 
167 aa  341  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  97.6 
 
 
167 aa  341  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  97.01 
 
 
167 aa  308  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  97.01 
 
 
167 aa  308  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  97.01 
 
 
167 aa  308  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  80.84 
 
 
167 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  80.84 
 
 
167 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  80.84 
 
 
167 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  80.84 
 
 
167 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  80.84 
 
 
167 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  76.19 
 
 
172 aa  251  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  67.66 
 
 
177 aa  241  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  65.87 
 
 
167 aa  234  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  65.87 
 
 
167 aa  234  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  65.87 
 
 
167 aa  234  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  67.52 
 
 
167 aa  226  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  64.07 
 
 
167 aa  226  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  65.61 
 
 
167 aa  226  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  62.66 
 
 
283 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  63.8 
 
 
322 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  61.39 
 
 
301 aa  210  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  65.82 
 
 
320 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  63.69 
 
 
349 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  65.66 
 
 
167 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  63.06 
 
 
347 aa  208  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  63.06 
 
 
349 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  69.44 
 
 
340 aa  207  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  60.12 
 
 
313 aa  200  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  62.42 
 
 
312 aa  196  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  64.33 
 
 
347 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  65.19 
 
 
309 aa  193  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  56.44 
 
 
334 aa  187  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  67.36 
 
 
340 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  67.36 
 
 
326 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  57.76 
 
 
170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  55.9 
 
 
173 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  51.1 
 
 
352 aa  178  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  52.26 
 
 
326 aa  166  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  46.2 
 
 
161 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  46.2 
 
 
307 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  42.5 
 
 
163 aa  142  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  39.75 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  37.34 
 
 
161 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  40.14 
 
 
161 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  37.18 
 
 
164 aa  110  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  37.11 
 
 
162 aa  99  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  39.04 
 
 
164 aa  95.5  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  34.16 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  35.97 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  35.97 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  31.47 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
309 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
163 aa  60.8  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  33.82 
 
 
387 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  32.59 
 
 
151 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.36 
 
 
316 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 
196 aa  57.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1922  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.26 
 
 
145 aa  58.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641628  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 
167 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  42.62 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
291 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7207  acetyltransferase  26.24 
 
 
208 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.58 
 
 
291 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.762819 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  34.44 
 
 
319 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
291 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  34.44 
 
 
319 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  30.37 
 
 
163 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  36.96 
 
 
153 aa  54.7  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
168 aa  54.3  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.473125 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  31.25 
 
 
238 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4192  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658468  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4649  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  34.07 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  30.97 
 
 
290 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
345 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  32.61 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.68 
 
 
156 aa  52  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2428  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
178 aa  51.2  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3196  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
169 aa  51.2  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>