More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12708 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  100 
 
 
163 aa  340  7e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  58.39 
 
 
161 aa  197  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
322 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  42.5 
 
 
167 aa  141  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  41.88 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  44.94 
 
 
301 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
347 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42.68 
 
 
349 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  42.68 
 
 
177 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  41.4 
 
 
167 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
320 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  44.1 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  44.1 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  44.1 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  44.1 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  44.1 
 
 
167 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  43.95 
 
 
283 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  42.04 
 
 
349 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  42.04 
 
 
167 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  42.04 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
340 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  42.04 
 
 
313 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  42.04 
 
 
167 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
167 aa  131  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  40.76 
 
 
167 aa  130  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  40.76 
 
 
312 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  42.04 
 
 
347 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 
167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  42.5 
 
 
167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 
167 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  41.88 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  41.88 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  41.88 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  43.67 
 
 
172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
161 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
309 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
173 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
340 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
326 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
334 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  38.22 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
326 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
307 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
352 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  38.22 
 
 
164 aa  107  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  38.61 
 
 
162 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
170 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  33.76 
 
 
161 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  34.18 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  27.01 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  35 
 
 
319 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  35 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
171 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0382  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
166 aa  60.8  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.179689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
305 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
171 aa  60.8  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  37.84 
 
 
238 aa  60.5  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3098  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 
309 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  30.17 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
327 aa  57.4  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  26.11 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  32.65 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
307 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
186 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1612  GCN5-related N-acetyltransferase  26.12 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122446  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0598  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
163 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408696  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  27.27 
 
 
169 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  26.24 
 
 
155 aa  54.3  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
163 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 
171 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2427  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
292 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1952  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 
192 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.941364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
315 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3260  acetyltransferase, GNAT family  29.52 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1924  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
291 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.71 
 
 
322 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.6 
 
 
304 aa  52.4  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
291 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2062  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
310 aa  52.4  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>