More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0840 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  336  9e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  63.12 
 
 		 164 aa  221  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  58.13 
 
 		 160 aa  207  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  45 
 
 		 312 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 313 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  45.34 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  43.83 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 		 167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  42.59 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  41.29 
 
 		 283 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  42.59 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  40.65 
 
 		 301 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 		 167 aa  131  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.33 
 
 		 349 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 349 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 347 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 320 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 309 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 347 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 340 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 322 aa  120  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 326 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  40.14 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 352 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  39.46 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  38.85 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 340 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 326 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 334 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  36.54 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  40.67 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  40.67 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  40.67 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  40.67 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  40 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  33.76 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  40.82 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 307 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  40.82 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  40.14 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  40.14 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  40.14 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  40.14 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  27.39 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  30 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.86 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  29.8 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  34.26 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 305 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  39.56 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  41.67 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  37.89 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1922  acetyltransferase (GNAT) family protein  32.41 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  35.79 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  35.79 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 299 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 315 aa  57.8  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  35.29 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  34.74 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.39 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0363  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  27.03 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00551848  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0711  acetyltransferase  30.97 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.02 
 
 		 304 aa  54.3  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>