299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2775 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  100 
 
 
312 aa  634    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  60.58 
 
 
349 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  60.58 
 
 
347 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  60.58 
 
 
349 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  58.28 
 
 
352 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  61.09 
 
 
347 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  60.81 
 
 
320 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  60.26 
 
 
313 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  62.84 
 
 
340 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  61.49 
 
 
309 aa  362  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  59.04 
 
 
334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  60.47 
 
 
322 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  62.84 
 
 
326 aa  352  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  62.84 
 
 
340 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  55.83 
 
 
283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  55 
 
 
301 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  44.15 
 
 
326 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
307 aa  228  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  64.97 
 
 
177 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  66.03 
 
 
173 aa  211  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  64.33 
 
 
167 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  64.33 
 
 
167 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  64.33 
 
 
167 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  64.15 
 
 
167 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  62.26 
 
 
167 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  63.69 
 
 
167 aa  200  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  63.06 
 
 
167 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  61.54 
 
 
167 aa  198  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  63.46 
 
 
170 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  63.8 
 
 
167 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  63.8 
 
 
167 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  63.8 
 
 
167 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  63.8 
 
 
167 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  63.19 
 
 
167 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  61.78 
 
 
172 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  63.06 
 
 
167 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  62.42 
 
 
167 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  62.42 
 
 
167 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  62.42 
 
 
167 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  62.42 
 
 
167 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  62.42 
 
 
167 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  58.97 
 
 
167 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  45 
 
 
161 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  43.95 
 
 
161 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
161 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  40.76 
 
 
163 aa  129  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  39.49 
 
 
164 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  33.76 
 
 
160 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  38.36 
 
 
162 aa  109  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
329 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
325 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
326 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
326 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
326 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  27.02 
 
 
321 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  37.74 
 
 
157 aa  98.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  29.18 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
326 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  28.47 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
336 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  35.76 
 
 
164 aa  90.5  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30 
 
 
326 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  27.02 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  38.13 
 
 
160 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
159 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
159 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  25.82 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  26.76 
 
 
313 aa  79  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.69 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.85 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
161 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  29.51 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.52 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  27.3 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.52 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 
150 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  26.45 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  22.3 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  37.38 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.27 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.91 
 
 
322 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  22.7 
 
 
310 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.89 
 
 
305 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 
168 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>