295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4525 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  630  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 305 aa  331  9e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  50.17 
 
 		 304 aa  289  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  47.12 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  48.16 
 
 		 312 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 308 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  50.34 
 
 		 326 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  46 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  44.41 
 
 		 308 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  43.96 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  43.29 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 308 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  44.19 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  43.91 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.8 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  59.33 
 
 		 163 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.83 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  49.03 
 
 		 162 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.54 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  39.35 
 
 		 161 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  39.35 
 
 		 161 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 		 161 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 		 166 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.74 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  29.03 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  34.75 
 
 		 848 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 340 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.05 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 143 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  32.44 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.07 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.92 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.38 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.91 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  26.07 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 		 162 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.79 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  42.27 
 
 		 167 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 		 162 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  24.23 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  23.89 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  34.12 
 
 		 160 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 		 171 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  24.42 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3801  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.54281  decreased coverage  0.000138892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  35.65 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 167 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34630  acetyltransferase  27.16 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  36.05 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  34.45 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1466  hypothetical protein  30.86 
 
 		 94 aa  55.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0594  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  31.06 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 		 168 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  34 
 
 		 162 aa  55.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>