More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3784 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
162 aa  330  5e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  69.75 
 
 
163 aa  241  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  70.37 
 
 
162 aa  237  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  70.37 
 
 
162 aa  234  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  69.81 
 
 
189 aa  232  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  67.92 
 
 
171 aa  229  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  68.55 
 
 
171 aa  229  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  67.3 
 
 
196 aa  228  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  59.89 
 
 
195 aa  214  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  62.96 
 
 
169 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  61.78 
 
 
164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  51.59 
 
 
162 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  53.15 
 
 
171 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  49.67 
 
 
163 aa  140  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  47.97 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  47.33 
 
 
168 aa  134  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  46.85 
 
 
166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  46.85 
 
 
166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
154 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  45.7 
 
 
380 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  45.64 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  42.07 
 
 
238 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  42.41 
 
 
387 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
156 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00551848  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 
167 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  39.07 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2929  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
161 aa  103  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0333345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
170 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  39.57 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.971308  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  35.92 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3907  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.84 
 
 
322 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  38.38 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  36.05 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  30.22 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0377  GCN5-related N-acetyltransferase  36.79 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294177  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  31.58 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.78 
 
 
289 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  31.58 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4192  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
188 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658468  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0387  putative acetyltransferase  30.14 
 
 
182 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47745  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2428  GCN5-related N-acetyltransferase  34.58 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  30.07 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
291 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
299 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.09 
 
 
294 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1922  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.69 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641628  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1535  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
188 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
170 aa  57.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  29.6 
 
 
167 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  37.37 
 
 
290 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  33 
 
 
153 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  28.8 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
310 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  34 
 
 
312 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1612  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122446  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  33.07 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3859  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 
188 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4319  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  36.9 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  28.8 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
307 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
291 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1692  acetyltransferase  34.31 
 
 
183 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.84 
 
 
291 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  30.71 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1699  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
183 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5878  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 
188 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703036  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3939  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 
188 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4427  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 
188 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
315 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
153 aa  53.9  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2409  acetyltransferase  34.31 
 
 
183 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2270  acetyltransferase  34.31 
 
 
183 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.811182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
150 aa  53.9  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0741  acetyltransferase  34.31 
 
 
245 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
314 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
340 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1709  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.674932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3645  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1679  acetyltransferase  34.31 
 
 
217 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1887  acetyltransferase  34.31 
 
 
217 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>