284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4902 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
195 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  66.12 
 
 
196 aa  234  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  64.48 
 
 
163 aa  232  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  63.93 
 
 
189 aa  230  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  61.54 
 
 
162 aa  226  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  59.89 
 
 
171 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  58.79 
 
 
171 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  60.77 
 
 
162 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  60.77 
 
 
162 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  57.14 
 
 
169 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  57.06 
 
 
164 aa  188  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  48.81 
 
 
171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  48.04 
 
 
162 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
163 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  43.27 
 
 
157 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  41.11 
 
 
168 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  41.62 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  41.62 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  43.86 
 
 
175 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  43.86 
 
 
154 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  36.84 
 
 
238 aa  112  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  42.05 
 
 
380 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  39.01 
 
 
387 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
167 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  35.5 
 
 
156 aa  101  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00551848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  37.87 
 
 
154 aa  101  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2929  GCN5-related N-acetyltransferase  32.75 
 
 
161 aa  96.3  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0333345  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.971308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  36.67 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  41.56 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  41.84 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  40.24 
 
 
161 aa  61.6  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.51 
 
 
322 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  41.3 
 
 
155 aa  61.6  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
310 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
161 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
155 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.56 
 
 
289 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  39.51 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3907  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0377  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
162 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294177  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  37.35 
 
 
161 aa  54.7  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  36.9 
 
 
151 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  50 
 
 
166 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
291 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  37.35 
 
 
184 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
307 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
160 aa  51.6  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
299 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
314 aa  51.2  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
177 aa  51.2  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
167 aa  51.2  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 
163 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  36.25 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  30.67 
 
 
319 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  30.67 
 
 
319 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2602  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229806  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  36.25 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
113 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
320 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2953  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
343 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  32.05 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.32 
 
 
294 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24460  acetyltransferase  28.95 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5807  hypothetical protein  41.94 
 
 
164 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  46.27 
 
 
162 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
340 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
150 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  30.38 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
156 aa  48.9  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
315 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
159 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
291 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
159 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  36.51 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  34.57 
 
 
156 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
156 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  46.67 
 
 
326 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
150 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
314 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
168 aa  48.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  38.55 
 
 
151 aa  48.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  33.96 
 
 
158 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.84 
 
 
316 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
158 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
316 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  32.05 
 
 
167 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
168 aa  48.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
305 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.29935  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>