More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4213 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
113 aa  230  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  41.44 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  45.28 
 
 
146 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  43.4 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  43.4 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  43.4 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  43.4 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  43.4 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  43.4 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  43.4 
 
 
146 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  43.64 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  41.28 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  42.45 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
151 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  42.45 
 
 
146 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  46.46 
 
 
154 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  40.37 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  42.99 
 
 
154 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
146 aa  87.4  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  45.36 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  38.74 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  43.43 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  43.88 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  36.94 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  40.4 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1812  GCN5-related N-acetyltransferase  40.4 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  40.4 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  42.42 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  43.88 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  49 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  43 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0593  GCN5-related N-acetyltransferase  36.04 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  42.42 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  40.82 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0541  acetyltransferase  34.23 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613141  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2876  GCN5-related N-acetyltransferase  56.7 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  38.32 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  34.58 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  36.08 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  32.73 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  34.34 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2038  hypothetical protein  33.71 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1596  putative acetyltransferase  36.36 
 
 
131 aa  62  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.987068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2106  hypothetical protein  34.48 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  40 
 
 
146 aa  60.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  46.38 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  42.7 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1504  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00105907  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  39.77 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  37.63 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1055  hypothetical protein  35.64 
 
 
153 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.499665  normal  0.357486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
179 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  48.15 
 
 
168 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  49.15 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  53.7 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  43.84 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1866  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.990958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  42.65 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  44.07 
 
 
207 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.29935  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1592  acetyltransferase  32.67 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.28 
 
 
162 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
175 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
400 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
414 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
414 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  41.86 
 
 
414 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5176  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  46.97 
 
 
335 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.472651 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  48.15 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0691  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
152 aa  53.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02800  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  44.62 
 
 
162 aa  53.9  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2987  acetyltransferase  39.33 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  45.59 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  41.94 
 
 
154 aa  52.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 
212 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71690  GNAT family acetyltransferase  44.12 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
152 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  46.97 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  45.59 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  46.97 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02392  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02843  acetyltransferase  37.88 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>