140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3827 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 151 aa  309  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  85.91 
 
 		 153 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  85.81 
 
 		 153 aa  264  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  85.81 
 
 		 153 aa  263  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  80.26 
 
 		 152 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0541  acetyltransferase  79.61 
 
 		 152 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613141  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  78.95 
 
 		 156 aa  251  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  79.61 
 
 		 152 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0593  GCN5-related N-acetyltransferase  76.97 
 
 		 152 aa  245  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  42.07 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  46.38 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  42.18 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  41.5 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  40.54 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  40.54 
 
 		 146 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  40.54 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  40.54 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  40.54 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  40.54 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  40.54 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  40.54 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  37.16 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  39.86 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  39.04 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  38.51 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  37.16 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 		 154 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  42.66 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1812  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  36.99 
 
 		 153 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  36.55 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  34.9 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  37.12 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  34.97 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2876  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1504  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00105907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2106  hypothetical protein  43.1 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1592  acetyltransferase  38.05 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2038  hypothetical protein  37.07 
 
 		 179 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119688  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  34.96 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1596  putative acetyltransferase  35.4 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.987068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  27.78 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  27.73 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0191  acetyltransferase  32.26 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  24.81 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  23.53 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0985  acetyltransferase  23.13 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0566002  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  26.56 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  26.56 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1761  putatative acetyltransferase  27.42 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389085  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1042  acetyltransferase  22.45 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0311529  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0819  acetyltransferase  22.45 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5539  GCN5-related N-acetyltransferase  23.88 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0963685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7133  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0250  GNAT family acetyltransferase  31.4 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01129  hypothetical protein  24.39 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  30.53 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4093  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1218  acetyltransferase  25.2 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.065696  normal  0.121515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  31.58 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0691  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.07 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3759  GCN5-related protein N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20491  putatative acetyltransferase  27.1 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0667747  normal  0.264372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2961  streptothricin acetyltransferase  29.47 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3185  streptothricin acetyltransferase  29.47 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.95857  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0683  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3192  putative streptothricin acetyltransferase  29.47 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0929  putative acetyltransferase  26.05 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0689  acetyltransferase  25.86 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00474298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  24.64 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>