98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1834 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
131 aa  261  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  65.87 
 
 
126 aa  173  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1504  GCN5-related N-acetyltransferase  64.57 
 
 
143 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00105907  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2106  hypothetical protein  55.47 
 
 
142 aa  144  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2038  hypothetical protein  52.1 
 
 
179 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1596  putative acetyltransferase  45.8 
 
 
131 aa  114  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.987068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  43.86 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  42.98 
 
 
146 aa  94.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  42.98 
 
 
146 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  42.98 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  42.98 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  42.98 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  42.98 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  42.98 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  42.98 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  42.11 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  42.06 
 
 
146 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  43.97 
 
 
153 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  43.12 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  43.1 
 
 
153 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  43.12 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  40.17 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1812  GCN5-related N-acetyltransferase  39.69 
 
 
154 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  39.69 
 
 
154 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  39.69 
 
 
154 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  41.88 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0593  GCN5-related N-acetyltransferase  40.17 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  38.35 
 
 
154 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0541  acetyltransferase  40.17 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613141  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  39.32 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  38.76 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  36.59 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  44.44 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  38.32 
 
 
149 aa  76.6  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  36.7 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  36.7 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  37.17 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1592  acetyltransferase  33.06 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2876  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  41.3 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  36.27 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  34.29 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  33.02 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  30.77 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  31.78 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2581  GCN5-related N-acetyltransferase  26.05 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  29.06 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3124  acetyltransferase, GNAT family  32.39 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  36.36 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  0.057406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 
173 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4022  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3229  acetyltransferase  26.73 
 
 
160 aa  43.5  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  33.87 
 
 
178 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  25.24 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0437  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.195322  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  27.35 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4682  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  31.78 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822416  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684291  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  24.55 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4231  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  38.46 
 
 
177 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  23.64 
 
 
153 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  23.3 
 
 
153 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4633  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  30.84 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635106  normal  0.946707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4633  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  30.84 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
160 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0418  acetyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0657723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  24.55 
 
 
158 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4549  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  29.91 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2590  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5609  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7133  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 
161 aa  40  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0250  GNAT family acetyltransferase  35.85 
 
 
163 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863666  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>