More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1896 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
151 aa  307  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  51.33 
 
 
150 aa  163  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  50.99 
 
 
154 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1812  GCN5-related N-acetyltransferase  50.99 
 
 
154 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  50.99 
 
 
154 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  50.99 
 
 
154 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  51.68 
 
 
154 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  54.48 
 
 
154 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  53.73 
 
 
154 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  51.68 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  53.73 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  45.32 
 
 
152 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  40.97 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  43.84 
 
 
146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 
152 aa  114  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  39.58 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  40.14 
 
 
153 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  38.89 
 
 
146 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  39.46 
 
 
153 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  38.89 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  38.19 
 
 
146 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  38.19 
 
 
146 aa  105  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  38.19 
 
 
146 aa  105  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  38.19 
 
 
146 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  38.89 
 
 
146 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  38.19 
 
 
146 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
152 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0541  acetyltransferase  37.84 
 
 
152 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613141  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  39.19 
 
 
156 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  40.6 
 
 
166 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  39.13 
 
 
148 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
151 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  37.16 
 
 
152 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0593  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
152 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  40.71 
 
 
147 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  37.84 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  40 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  35.92 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  41.5 
 
 
152 aa  96.7  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  38.69 
 
 
148 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
166 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  35.86 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2876  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
147 aa  84  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2106  hypothetical protein  42.42 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  39.56 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  38.32 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2038  hypothetical protein  40.66 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1596  putative acetyltransferase  43.42 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.987068  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  32.04 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1504  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00105907  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2615  GCN5-related N-acetyltransferase  33.03 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3005  acetyltransferase, GNAT family  33.03 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1592  acetyltransferase  27.4 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
148 aa  60.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
173 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.055789  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3124  acetyltransferase, GNAT family  35.53 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2214  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
167 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
414 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5539  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0963685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
413 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33160  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.66 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0204184  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3229  acetyltransferase  40.54 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  29.46 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
400 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2581  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
414 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2912  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196361 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
414 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4022  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
413 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4231  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
399 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  28.1 
 
 
163 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  27.69 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2582  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
161 aa  53.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0600  argininosuccinate synthase (citrulline--aspartateligase)  23.49 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0548  acetyltransferase  22.76 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.995158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0418  acetyltransferase  34.67 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0657723 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2131  diamine acetyltransferase 2  21.01 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000287953  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2590  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01129  hypothetical protein  28.1 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
162 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04197  N-acetyltransferase  28.17 
 
 
163 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
169 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0976  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.416223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>