242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4095 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  71.43 
 
 
147 aa  207  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  70.75 
 
 
147 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  47.55 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  46.62 
 
 
154 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
154 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  42.47 
 
 
153 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  39.33 
 
 
151 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 
151 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
147 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  37.41 
 
 
146 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  37.41 
 
 
146 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
146 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  37.41 
 
 
146 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
150 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  37.41 
 
 
146 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  37.41 
 
 
146 aa  101  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  37.41 
 
 
146 aa  101  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  37.41 
 
 
146 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  36.73 
 
 
146 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
146 aa  101  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  37.41 
 
 
146 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 
154 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 
154 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1812  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 
154 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  35.95 
 
 
156 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
146 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  41.96 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
148 aa  99  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  42.66 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  38.69 
 
 
148 aa  98.6  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0541  acetyltransferase  36 
 
 
152 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613141  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  38.41 
 
 
148 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  38.41 
 
 
154 aa  97.4  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
152 aa  97.4  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0593  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  38.19 
 
 
149 aa  94  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  40.71 
 
 
166 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  34.67 
 
 
153 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  34.67 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2876  GCN5-related N-acetyltransferase  43.26 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
113 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2038  hypothetical protein  37.61 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1504  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00105907  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2106  hypothetical protein  37.25 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1596  putative acetyltransferase  31.01 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.987068  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
131 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 
126 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1592  acetyltransferase  28.78 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5119  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000288207  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 
414 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
131 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4179  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  27.82 
 
 
146 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
149 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
173 aa  51.2  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
399 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2189  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 
204 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000236474 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  30.7 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2012  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.420393  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1954  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0219812  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4093  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  27.46 
 
 
148 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5393  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650664  hitchhiker  0.00916992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0311  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126839  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3710  acetyltransferase, GNAT family  44.64 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2912  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
145 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1765  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
182 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40130  hypothetical protein  35.24 
 
 
177 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
195 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00567741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 
162 aa  47.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1361  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  27.94 
 
 
153 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
414 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
174 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
414 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
400 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>