61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2038 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2038  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2106  hypothetical protein  53.23 
 
 
142 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  53.78 
 
 
126 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  52.1 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1596  putative acetyltransferase  48.7 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.987068  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1504  GCN5-related N-acetyltransferase  53.04 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00105907  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  44.04 
 
 
146 aa  91.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  36.52 
 
 
150 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  39.05 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  39.05 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  39.05 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  39.05 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  39.05 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  39.05 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  37.04 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  40 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  39.05 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
146 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  36.11 
 
 
147 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2876  GCN5-related N-acetyltransferase  40.66 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  38.1 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0541  acetyltransferase  38.46 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613141  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  40.22 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  40.22 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0593  GCN5-related N-acetyltransferase  37.61 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  37.07 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  37.74 
 
 
148 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  35.92 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  36.75 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  37.07 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  37.61 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  37.07 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  35.51 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  40.66 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  42.22 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1812  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  34.29 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1592  acetyltransferase  29.55 
 
 
145 aa  62  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  35.29 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0967  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
331 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.776214  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  30.43 
 
 
163 aa  45.1  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>