106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2754 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
126 aa  254  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  65.87 
 
 
131 aa  173  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1504  GCN5-related N-acetyltransferase  61.11 
 
 
143 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00105907  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2038  hypothetical protein  53.78 
 
 
179 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2106  hypothetical protein  53.91 
 
 
142 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1596  putative acetyltransferase  39.37 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.987068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  39.47 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  40.35 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  38.68 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  40.35 
 
 
146 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  40.35 
 
 
146 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  41.9 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  39.47 
 
 
146 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  39.47 
 
 
146 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  39.47 
 
 
146 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  39.47 
 
 
146 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  39.47 
 
 
146 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  39.47 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  38.53 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  33.33 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  35.34 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  35.34 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  37.07 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  36.44 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1592  acetyltransferase  35.59 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0541  acetyltransferase  36.75 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613141  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  37.61 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1812  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  36.21 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  39.56 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  35.04 
 
 
156 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  36.84 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0593  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  34.96 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  37.11 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2876  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  40.22 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  32.71 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  31.78 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  34.31 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  30.48 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
164 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  49.02 
 
 
163 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  52.08 
 
 
173 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  48.08 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  48.08 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3124  acetyltransferase, GNAT family  34.29 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  40.35 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  51.02 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  38.98 
 
 
178 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5609  GCN5-related N-acetyltransferase  28.44 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684291  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  48.98 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  48.98 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  34.92 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  37.1 
 
 
163 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  40.38 
 
 
171 aa  43.9  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  24.3 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0405338  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  46.94 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0408298  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  31.53 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2581  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
165 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
153 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  25.86 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  26.27 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
158 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
160 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2214  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  28.83 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  26.73 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0437  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.195322  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  27.72 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3333  hypothetical protein  34.48 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.673075  hitchhiker  0.00810135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  0.057406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1688  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  24.07 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>