59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1596 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1596  putative acetyltransferase  100 
 
 		 131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.987068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2038  hypothetical protein  48.7 
 
 		 179 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  45.8 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2106  hypothetical protein  50.44 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1504  GCN5-related N-acetyltransferase  45.69 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00105907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  39.37 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  35.45 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  35.45 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  35.45 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  35.45 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  35.45 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  35.45 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  35.45 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  35.45 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  35.45 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  37.84 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  32.81 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  36.7 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  38.39 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2876  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  37.5 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  40.21 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  34.58 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  39.18 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  39.18 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  35.85 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  37.27 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  37.27 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  36.45 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  43.42 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  30.7 
 
 		 151 aa  67  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  33.02 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0593  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0541  acetyltransferase  33.33 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  34.82 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1812  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  38.38 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1592  acetyltransferase  31.71 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  26.05 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  22.76 
 
 		 148 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 		 148 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  0.492654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>