126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0541 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0541  acetyltransferase  100 
 
 
152 aa  312  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613141  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  99.34 
 
 
152 aa  310  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  96.71 
 
 
152 aa  304  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0593  GCN5-related N-acetyltransferase  92.76 
 
 
152 aa  293  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  86.18 
 
 
153 aa  275  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  80.26 
 
 
156 aa  267  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  79.61 
 
 
151 aa  251  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  78.29 
 
 
153 aa  250  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  76.97 
 
 
153 aa  246  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  40.69 
 
 
150 aa  124  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  40.94 
 
 
166 aa  115  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  40.27 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
148 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  38.26 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  38.26 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  38.26 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  38.26 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  38.26 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  38.26 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  38.26 
 
 
146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
146 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  37.58 
 
 
146 aa  104  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  35.33 
 
 
147 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
150 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  34.67 
 
 
147 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
151 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  41.96 
 
 
152 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  36.18 
 
 
151 aa  100  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
154 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  36.24 
 
 
146 aa  100  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  35.14 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
166 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1812  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
154 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
154 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
154 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  35.86 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  33.78 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  36.03 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2876  GCN5-related N-acetyltransferase  40.28 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  34.33 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1504  GCN5-related N-acetyltransferase  41.88 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00105907  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2106  hypothetical protein  41.98 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  34.72 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  40.17 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1592  acetyltransferase  37.72 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2038  hypothetical protein  38.46 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119688  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1596  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.987068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  27.34 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7133  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0250  GNAT family acetyltransferase  33.33 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863666  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0689  acetyltransferase  27.27 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00474298  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5539  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0963685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  26.87 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  28.21 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  27.2 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
150 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1227  acetyltransferase  26.02 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  28.21 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1068  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3192  putative streptothricin acetyltransferase  28.57 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2961  streptothricin acetyltransferase  28.57 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3185  streptothricin acetyltransferase  28.57 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.95857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  25.44 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0191  acetyltransferase  28.45 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  27.05 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1706  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.18989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0592  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  27.05 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  25.6 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.12 
 
 
159 aa  44.3  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2335  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 
146 aa  43.9  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00213178  normal  0.015977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3197  streptothricin acetyltransferase, putative  29.47 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288156  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.315847  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3690  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158897  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  26.09 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.81 
 
 
371 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60277  N-acetyltransferase HPA3  26.17 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.055789  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0976  GCN5-related N-acetyltransferase  24.47 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2583  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0675931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>