More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1313 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  100 
 
 
163 aa  339  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3229  acetyltransferase  48.05 
 
 
160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  45.28 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3124  acetyltransferase, GNAT family  41.72 
 
 
163 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
160 aa  134  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  41.72 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  43.23 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2590  GCN5-related N-acetyltransferase  42.58 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2014  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 
173 aa  132  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2214  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2627  GCN5-related N-acetyltransferase  42.68 
 
 
159 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0418  acetyltransferase  43.59 
 
 
184 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0657723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2581  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
165 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3005  acetyltransferase, GNAT family  37.5 
 
 
160 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2615  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
160 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1688  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2412  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0178488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  37 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  35.87 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158897  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  32.8 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  35.87 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.808997 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
168 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  38.37 
 
 
171 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  37.35 
 
 
157 aa  60.8  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
158 aa  60.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  35.87 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  0.057406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  35.71 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0408298  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02661  putative N-acetyltransferase  34.78 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.967011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0250  GNAT family acetyltransferase  34.38 
 
 
163 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863666  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7133  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
170 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  37.78 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5609  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
163 aa  57.8  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  39.29 
 
 
163 aa  57.4  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0437  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
157 aa  57.4  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.195322  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4022  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
159 aa  57.4  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4231  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
159 aa  57.4  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2444  acetyltransferase, GNAT family  33.72 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  38.96 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.678538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  32.38 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06250  GNAT family acetyltransferase  33.33 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129837  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  34.44 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2131  diamine acetyltransferase 2  33.71 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000287953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0584  putative N-acetyltransferase  33.33 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
159 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3724  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
151 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.68 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  28.32 
 
 
156 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674163 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02479  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02980)  38.46 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  36.25 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0429  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2681  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04197  N-acetyltransferase  32.95 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0548  acetyltransferase  30.16 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.995158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
163 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649129  normal  0.528305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2450  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5816  acetyltransferase  36 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0534  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.73 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1702  acetyltransferase  33.33 
 
 
160 aa  51.2  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0061142  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2807  acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  36.51 
 
 
364 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2496  acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0177281  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2786  acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.113285  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0515  acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2923  acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00907256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2868  acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0600  argininosuccinate synthase (citrulline--aspartateligase)  31.87 
 
 
159 aa  51.2  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1819  acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025804  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0626  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1064  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141441  normal  0.157101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>