192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2066 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
160 aa  328  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  53.8 
 
 
163 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3124  acetyltransferase, GNAT family  53.16 
 
 
163 aa  194  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3229  acetyltransferase  54.37 
 
 
160 aa  192  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2581  GCN5-related N-acetyltransferase  57.05 
 
 
165 aa  190  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  51.28 
 
 
161 aa  166  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2627  GCN5-related N-acetyltransferase  53.8 
 
 
159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  47.77 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2590  GCN5-related N-acetyltransferase  49.36 
 
 
173 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2214  GCN5-related N-acetyltransferase  47.77 
 
 
167 aa  157  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2014  GCN5-related N-acetyltransferase  48.47 
 
 
173 aa  153  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0418  acetyltransferase  51.08 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0657723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  45.28 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2615  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 
160 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3005  acetyltransferase, GNAT family  38.61 
 
 
160 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  40.2 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  43.33 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  40.22 
 
 
171 aa  67  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  40.59 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  36.36 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0408298  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0178488  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2412  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
195 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.808997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
162 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  32.63 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4231  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
169 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  35.4 
 
 
163 aa  57.4  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  32.95 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5816  acetyltransferase  31.4 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4022  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02661  putative N-acetyltransferase  31.37 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.967011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5609  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33160  acetyltransferase (GNAT) family protein  31.82 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0204184  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  0.057406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0429  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 
167 aa  54.7  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
159 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2681  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1688  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
131 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0690  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3689  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.950669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0602  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
168 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.047799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1064  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
161 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141441  normal  0.157101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0985  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.622918 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1640  acetyltransferase  31.33 
 
 
150 aa  52  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0813  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0626  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
161 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0981  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.069585 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1105  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
161 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0515  acetyltransferase  30.68 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2923  acetyltransferase  30.68 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00907256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2496  acetyltransferase  30.68 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0177281  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2786  acetyltransferase  30.68 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.113285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2807  acetyltransferase  30.68 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2868  acetyltransferase  30.68 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1819  acetyltransferase  30.68 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2307  acetyltransferase  31.48 
 
 
282 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0323489  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1702  acetyltransferase  30.68 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0061142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2622  acetyltransferase, GNAT family  30.56 
 
 
282 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000149947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2346  acetyltransferase  30.56 
 
 
282 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000550372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2569  acetyltransferase  30.56 
 
 
282 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2444  acetyltransferase, GNAT family  27.91 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3724  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4218  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04197  N-acetyltransferase  30.23 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.678538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2910  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2390  acetyltransferase  30.28 
 
 
282 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0672236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2579  acetyltransferase, GNAT family  30.28 
 
 
282 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000394368 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2566  acetyltransferase  30.28 
 
 
282 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0405338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000236474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2131  diamine acetyltransferase 2  29.36 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000287953  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06250  GNAT family acetyltransferase  26.92 
 
 
158 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129837  normal  0.1254 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>