179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2849 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  100 
 
 
153 aa  314  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  77.18 
 
 
154 aa  246  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  77.18 
 
 
154 aa  245  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  76.67 
 
 
154 aa  244  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  71.81 
 
 
154 aa  224  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  67.79 
 
 
154 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  67.79 
 
 
154 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1812  GCN5-related N-acetyltransferase  67.79 
 
 
154 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  67.11 
 
 
154 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  51.68 
 
 
151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  52.99 
 
 
150 aa  147  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
152 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  41.13 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  50.75 
 
 
152 aa  117  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  40.82 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  42.96 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  42.25 
 
 
147 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  39.86 
 
 
146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  39.86 
 
 
146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  39.86 
 
 
146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 
166 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  40.74 
 
 
148 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  39.86 
 
 
146 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  39.16 
 
 
146 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  39.16 
 
 
146 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  39.16 
 
 
146 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  39.16 
 
 
146 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  39.16 
 
 
146 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
146 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  38.93 
 
 
153 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  38.26 
 
 
153 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  38.41 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  39.55 
 
 
166 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
151 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  36.55 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
147 aa  94  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0593  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
152 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  35.14 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0541  acetyltransferase  33.78 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613141  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  35.46 
 
 
152 aa  87.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  35.83 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1504  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00105907  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2876  GCN5-related N-acetyltransferase  38.62 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
126 aa  77  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2038  hypothetical protein  35.92 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2106  hypothetical protein  36.19 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1592  acetyltransferase  30.14 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1596  putative acetyltransferase  38.38 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.987068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4093  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1461  GCN5-related N-acetyltransferase  43.08 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3124  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505019  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1761  putatative acetyltransferase  41.18 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20491  putatative acetyltransferase  46.43 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0667747  normal  0.264372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46600  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.395219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  27.21 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5539  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0963685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2581  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
163 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  25.21 
 
 
158 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  28.36 
 
 
146 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
173 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.055789  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
158 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  26.89 
 
 
152 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
162 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0619  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00515533  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0363  GCN5-related N-acetyltransferase  28.35 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791622  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2131  diamine acetyltransferase 2  23.78 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000287953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  30.26 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0418  acetyltransferase  31.65 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0657723 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49336  predicted protein  27.45 
 
 
218 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3837  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000098197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4989  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  hitchhiker  0.00545229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  30.77 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3179  putative streptothricin acetyltransferase  35.71 
 
 
186 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1149  acetyltransferase  35.53 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2681  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
173 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3192  putative streptothricin acetyltransferase  28.95 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>