More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3661 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  100 
 
 
146 aa  308  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
147 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  30.77 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  30.07 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  34.45 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0178488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  30.08 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  29.25 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  28.03 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7546  putative acetyltransferase protein  27.89 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  28.03 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4022  GCN5-related N-acetyltransferase  38.55 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2412  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  28.03 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  28.03 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  28.03 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  28.03 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  28.03 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  31.25 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  31.39 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2681  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
173 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
169 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  28.03 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
163 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649129  normal  0.528305 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4231  GCN5-related N-acetyltransferase  38.55 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4218  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
169 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
179 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
165 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
153 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  29.45 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  31.11 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0985  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.622918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0981  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  26.81 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  26.52 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  35.8 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
212 aa  58.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0250  GNAT family acetyltransferase  33.73 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863666  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7133  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1064  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141441  normal  0.157101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0626  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  29.1 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1105  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0437  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.195322  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3690  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 
160 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
152 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  37.21 
 
 
165 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
160 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0408298  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2450  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  26.62 
 
 
153 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  38.67 
 
 
163 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1688  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 
166 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2444  acetyltransferase, GNAT family  27.14 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02661  putative N-acetyltransferase  37.93 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.967011  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3724  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.669908  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  30.71 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  25 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0561  putative acetyltransferase  34.41 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.808997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09990  putative acetyltransferase  30.14 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175715  normal  0.714198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>