68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2106 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2106  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  55.47 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2038  hypothetical protein  53.23 
 
 		 179 aa  140  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1504  GCN5-related N-acetyltransferase  51.47 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00105907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  53.91 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1596  putative acetyltransferase  50.44 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.987068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000140005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  42.61 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  38.64 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  38.64 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  38.64 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  38.64 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  38.64 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  43.59 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  38.64 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  43.97 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  37.88 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  37.88 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12798  acetyltransferase, GNAT family protein  39.5 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0541  acetyltransferase  41.98 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  37.88 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  43.59 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  43.1 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  42.74 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  44.34 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0593  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  43.4 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2876  GCN5-related N-acetyltransferase  43.01 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  38.32 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  38.53 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  38.74 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  39.82 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  36.8 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  39.09 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  43.33 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  42.22 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  42.22 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  41.11 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  41.11 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1812  GCN5-related N-acetyltransferase  41.11 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  36.19 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  34.86 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1592  acetyltransferase  35.45 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  40.82 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4873  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  37.76 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4814  GCN5-related N-acetyltransferase  37.63 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893862  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  29.52 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  26.77 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  26.77 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  34.33 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  32.31 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  26.32 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  28.91 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  25.45 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  21.71 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0405338  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  26.61 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.714516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>