More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2225 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  100 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  64.1 
 
 
158 aa  207  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  69.23 
 
 
152 aa  207  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  68.59 
 
 
152 aa  203  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  52.11 
 
 
153 aa  152  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  53.06 
 
 
170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  49.01 
 
 
160 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  45.51 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  48.99 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  46.62 
 
 
159 aa  121  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  44.59 
 
 
152 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  43.62 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
156 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  42.21 
 
 
160 aa  95.5  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
157 aa  93.6  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  41.94 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 
158 aa  92  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  40.41 
 
 
164 aa  91.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  38.51 
 
 
151 aa  91.3  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  40.78 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
291 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  44.66 
 
 
149 aa  84.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.108624 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  37.12 
 
 
160 aa  84  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
155 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  34.69 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  37.16 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  34.64 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  33.77 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  42.98 
 
 
290 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  35.97 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
153 aa  82  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  44.34 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.35 
 
 
291 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  40.17 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.762819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  40.38 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.23 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  32.7 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  38.03 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  33.56 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  36.43 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  37.32 
 
 
156 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  33.77 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
128 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  32.89 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2831  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.088011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2953  GCN5-related N-acetyltransferase  40.95 
 
 
343 aa  75.1  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5984  GCN5-related N-acetyltransferase  38.93 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  36.79 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  40.21 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  38.41 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.89 
 
 
289 aa  71.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  42.22 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  45.78 
 
 
322 aa  70.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  36.11 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09031  transcriptional regulator, MarR family protein  36.84 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3687  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.96 
 
 
294 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3831  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0219  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  36.7 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1301  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231275  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  33.66 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  42.17 
 
 
238 aa  63.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  35.79 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>