289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1061 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
158 aa  320  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  74.17 
 
 
152 aa  221  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  72.67 
 
 
152 aa  216  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  64.1 
 
 
161 aa  207  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  50.33 
 
 
153 aa  143  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
170 aa  138  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  47.4 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  46 
 
 
162 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  44.14 
 
 
159 aa  117  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  43.79 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  43.05 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  38.41 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
156 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  35.86 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  39.23 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  42.06 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  40 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  38.13 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  35.92 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  37.14 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  32.59 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  41.13 
 
 
166 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  40.83 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  39.44 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  41.41 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  41.75 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  42.31 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  44.23 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.108624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  36.97 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  41.9 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  39.42 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.762819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2953  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  46.51 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  36.36 
 
 
322 aa  67.8  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.38 
 
 
291 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  48.1 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.46 
 
 
291 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  38 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3687  GCN5-related N-acetyltransferase  39.32 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2831  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.088011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
177 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  42.22 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42.11 
 
 
289 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  27.94 
 
 
184 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.75 
 
 
294 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  38.14 
 
 
167 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
151 aa  61.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  36.36 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
141 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  30.92 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  36.28 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5914  GCN5-related N-acetyltransferase  42.22 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  35.54 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1612  GCN5-related N-acetyltransferase  30.71 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122446  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7207  acetyltransferase  40 
 
 
208 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
381 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
167 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  33.97 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0219  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5200  acetyltransferase  37.04 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  33 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00551848  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  39.76 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0406  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  32.04 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3831  GCN5-related N-acetyltransferase  40.51 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  41.18 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>