137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1587 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
153 aa  320  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  66.89 
 
 
156 aa  207  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  62.16 
 
 
152 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  61.74 
 
 
151 aa  197  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  61.18 
 
 
156 aa  190  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  62.16 
 
 
151 aa  189  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  57.62 
 
 
158 aa  183  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  58.28 
 
 
151 aa  181  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  57.72 
 
 
151 aa  181  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  56.95 
 
 
155 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  56.95 
 
 
151 aa  180  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  56.95 
 
 
151 aa  180  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  56.29 
 
 
151 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  55.63 
 
 
163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  56.29 
 
 
151 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  58.39 
 
 
152 aa  176  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  55.7 
 
 
151 aa  169  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  59.29 
 
 
157 aa  163  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  51.01 
 
 
151 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  48.34 
 
 
167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  50.99 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  49.01 
 
 
152 aa  148  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2831  GCN5-related N-acetyltransferase  51.01 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.088011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  53.57 
 
 
141 aa  141  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  51.13 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  44.37 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  46.48 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  51.5 
 
 
177 aa  138  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1714  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 
159 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.493786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1249  acetyltransferase  46.58 
 
 
159 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348752  normal  0.648372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2707  acetyltransferase, GNAT family  46.58 
 
 
159 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.343718  normal  0.29302 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0459  GCN5-related N-acetyltransferase  43.05 
 
 
154 aa  130  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.359836  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  46.31 
 
 
156 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  48.99 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  50.77 
 
 
156 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  44.97 
 
 
159 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  45.11 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3725  GCN5-related N-acetyltransferase  44.12 
 
 
160 aa  116  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3562  GCN5-related N-acetyltransferase  43.45 
 
 
162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2710  acetyltransferase, gnat family  50.57 
 
 
99 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.941065  normal  0.335469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  35.53 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4877  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667695  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  30.66 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  37.12 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  40.2 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
156 aa  60.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  26.98 
 
 
158 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  29.58 
 
 
319 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  30.16 
 
 
319 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  30.58 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.09 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0387  putative acetyltransferase  28.57 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47745  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2254  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2122  N-acetylglutamate synthase  30 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2168  N-acetylglutamate synthase  30 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121288  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2109  N-acetylglutamate synthase  30 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0656379 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  27.37 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.46 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 
304 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0165  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  26.26 
 
 
161 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31320  acetyltransferase  35.8 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128466  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  24.85 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
340 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5807  hypothetical protein  30.47 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.108624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34630  acetyltransferase  34.74 
 
 
212 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  24.11 
 
 
364 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
175 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.33 
 
 
310 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3990  N-acetylglutamate synthase  31.71 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266966  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
326 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2806  N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000042501  hitchhiker  0.0000370361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4319  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>