213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1474 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
156 aa  327  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  66.89 
 
 
153 aa  207  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  58.71 
 
 
156 aa  190  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  55.92 
 
 
152 aa  180  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  55.63 
 
 
151 aa  176  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  54.97 
 
 
151 aa  176  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  59.72 
 
 
157 aa  175  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  56.08 
 
 
151 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  56.08 
 
 
151 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  52.03 
 
 
151 aa  163  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  56.08 
 
 
155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  55.41 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  55.41 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  55.41 
 
 
151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  55.41 
 
 
151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  54.73 
 
 
163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  54.3 
 
 
151 aa  160  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  50.68 
 
 
151 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  53.22 
 
 
177 aa  153  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  50.68 
 
 
152 aa  151  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
151 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  47.97 
 
 
151 aa  144  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  47.3 
 
 
152 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2707  acetyltransferase, GNAT family  47.02 
 
 
159 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.343718  normal  0.29302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1249  acetyltransferase  47.02 
 
 
159 aa  141  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348752  normal  0.648372 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1714  GCN5-related N-acetyltransferase  47.02 
 
 
159 aa  140  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.493786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2831  GCN5-related N-acetyltransferase  46.94 
 
 
155 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.088011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  43.05 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  51.82 
 
 
141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  40.67 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  41.91 
 
 
160 aa  114  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  41.55 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0459  GCN5-related N-acetyltransferase  40.27 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.359836  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3725  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3562  GCN5-related N-acetyltransferase  42.18 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  43.05 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
159 aa  100  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2710  acetyltransferase, gnat family  53.26 
 
 
99 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.941065  normal  0.335469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
152 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4877  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667695  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  35.37 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  35.86 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  38.68 
 
 
128 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  31.85 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  27.87 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  33.03 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
175 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  32.58 
 
 
319 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  32.58 
 
 
319 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  35.63 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.971308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  29.9 
 
 
154 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0165  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
147 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
161 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2254  GCN5-related N-acetyltransferase  34.74 
 
 
166 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3450  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5801  N-acetylglutamate synthase  30.43 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.505653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0598  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408696  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31320  acetyltransferase  33.71 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128466  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.108624 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
326 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2122  N-acetylglutamate synthase  31.46 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2168  N-acetylglutamate synthase  31.46 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121288  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2109  N-acetylglutamate synthase  31.46 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0656379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1365  putative acetyltransferase  26.36 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2806  N-acetylglutamate synthase  35.8 
 
 
173 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000042501  hitchhiker  0.0000370361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
189 aa  48.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6126  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
196 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
327 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1238  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  27.66 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3544  GCN5-related N-acetyltransferase  34.41 
 
 
140 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287849  normal  0.122011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  37.11 
 
 
170 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  28.3 
 
 
238 aa  47  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3990  N-acetylglutamate synthase  33.8 
 
 
161 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266966  normal  0.334799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>