154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3527 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
151 aa  318  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  59.6 
 
 
151 aa  191  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  59.6 
 
 
151 aa  191  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  58.94 
 
 
158 aa  190  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  58.94 
 
 
151 aa  190  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  58.28 
 
 
151 aa  188  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  58.94 
 
 
155 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  58.94 
 
 
151 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  58.28 
 
 
163 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  57.62 
 
 
151 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  54.97 
 
 
152 aa  174  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  54.05 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  50.99 
 
 
151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  52.32 
 
 
151 aa  167  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  52.98 
 
 
151 aa  167  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  51.66 
 
 
151 aa  166  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  48.34 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  50.68 
 
 
156 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  51.01 
 
 
153 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  48.99 
 
 
151 aa  154  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  49.65 
 
 
152 aa  150  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  47.92 
 
 
167 aa  150  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  54.68 
 
 
141 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  50.68 
 
 
157 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  50.36 
 
 
153 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1249  acetyltransferase  44.44 
 
 
159 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348752  normal  0.648372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2707  acetyltransferase, GNAT family  44.44 
 
 
159 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.343718  normal  0.29302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  51.11 
 
 
153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2831  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
155 aa  133  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.088011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  50.74 
 
 
160 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1714  GCN5-related N-acetyltransferase  43.06 
 
 
159 aa  130  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.493786  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  48.12 
 
 
156 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  48.12 
 
 
156 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  46.15 
 
 
157 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  44.51 
 
 
177 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  45.32 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0459  GCN5-related N-acetyltransferase  43.26 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.359836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3725  GCN5-related N-acetyltransferase  42.02 
 
 
160 aa  100  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3562  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2710  acetyltransferase, gnat family  48.35 
 
 
99 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.941065  normal  0.335469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  37.32 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  37.32 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  34.04 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  37.16 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  36.43 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4877  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667695  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  38.58 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  36.94 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
158 aa  60.5  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  38.14 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  38.37 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  41.25 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  35.48 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
157 aa  53.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3831  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
167 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31320  acetyltransferase  33.71 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128466  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0219  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  40.22 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.290046  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3907  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
203 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.51 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  27 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  27 
 
 
166 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  27 
 
 
166 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.4 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32 
 
 
156 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  34.88 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9151  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase-like protein  29.31 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3450  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  28.35 
 
 
319 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  26.15 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.971308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  31.78 
 
 
312 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.93 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  30.84 
 
 
407 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  27 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  34.34 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.07 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2806  N-acetylglutamate synthase  28.75 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000042501  hitchhiker  0.0000370361 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10390  acetyltransferase  33.73 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
189 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>