162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3403 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
152 aa  315  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  58.94 
 
 
151 aa  194  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  58.28 
 
 
151 aa  183  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  58.28 
 
 
151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  57.62 
 
 
158 aa  179  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  58.39 
 
 
153 aa  176  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  55.63 
 
 
151 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  55.63 
 
 
151 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  55.63 
 
 
155 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  55.63 
 
 
163 aa  173  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  55.63 
 
 
151 aa  173  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  54.97 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2707  acetyltransferase, GNAT family  51.68 
 
 
159 aa  166  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.343718  normal  0.29302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1249  acetyltransferase  51.68 
 
 
159 aa  166  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348752  normal  0.648372 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1714  GCN5-related N-acetyltransferase  51.01 
 
 
159 aa  165  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.493786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  53.64 
 
 
151 aa  164  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  53.64 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  54.3 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  52.32 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  51.35 
 
 
156 aa  157  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  50.99 
 
 
152 aa  155  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  50.33 
 
 
167 aa  153  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2831  GCN5-related N-acetyltransferase  50.68 
 
 
155 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.088011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  49.65 
 
 
151 aa  150  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  55 
 
 
157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  46.36 
 
 
151 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  47.3 
 
 
156 aa  141  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0459  GCN5-related N-acetyltransferase  47.26 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.359836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3562  GCN5-related N-acetyltransferase  46.9 
 
 
162 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3725  GCN5-related N-acetyltransferase  46.21 
 
 
160 aa  133  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  54.29 
 
 
141 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  45.03 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  47.34 
 
 
177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  44.14 
 
 
153 aa  127  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  45.03 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
153 aa  117  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  45.03 
 
 
157 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  40.29 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2710  acetyltransferase, gnat family  52.75 
 
 
99 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.941065  normal  0.335469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4877  GCN5-related N-acetyltransferase  40.82 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667695  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  39.34 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  42.96 
 
 
170 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  34.53 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  33.09 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
407 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0387  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47745  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.762819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  41.46 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1365  putative acetyltransferase  35.71 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2930  acetyltransferase  29.51 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  31.97 
 
 
156 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
153 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  26.23 
 
 
156 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
151 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34680  acetyltransferase (GNAT) family protein  46.67 
 
 
200 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10134  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5200  acetyltransferase  31.31 
 
 
180 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972339  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4319  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.64 
 
 
291 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0406  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
176 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0523  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
186 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1535  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 
188 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3859  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.5 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4192  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658468  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1692  acetyltransferase  39.19 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1679  acetyltransferase  30.65 
 
 
217 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1887  acetyltransferase  30.65 
 
 
217 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0559  acetyltransferase  30.65 
 
 
217 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  34.95 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5807  hypothetical protein  32.37 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0741  acetyltransferase  30.65 
 
 
245 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2409  acetyltransferase  39.19 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2270  acetyltransferase  39.19 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.811182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>