142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1106 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  100 
 
 
151 aa  314  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  52.98 
 
 
151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  52.98 
 
 
155 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  53.69 
 
 
158 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  52.98 
 
 
151 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  52.32 
 
 
151 aa  167  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  52.32 
 
 
151 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  52.32 
 
 
163 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  52.32 
 
 
151 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  52.98 
 
 
151 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  50.33 
 
 
151 aa  159  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  46.36 
 
 
151 aa  156  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  45.7 
 
 
152 aa  149  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  46.36 
 
 
152 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  47.68 
 
 
151 aa  147  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  45.7 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  47.97 
 
 
156 aa  144  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  46.36 
 
 
152 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  45.03 
 
 
151 aa  140  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  44.37 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  47.37 
 
 
157 aa  136  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  40.4 
 
 
167 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  46.62 
 
 
156 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1714  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.493786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2831  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 
155 aa  124  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.088011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  41.72 
 
 
153 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
141 aa  123  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1249  acetyltransferase  42 
 
 
159 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348752  normal  0.648372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2707  acetyltransferase, GNAT family  42 
 
 
159 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.343718  normal  0.29302 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  45.7 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  41.72 
 
 
156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  41.72 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0459  GCN5-related N-acetyltransferase  43.71 
 
 
154 aa  117  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.359836  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  44.19 
 
 
177 aa  116  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  41.06 
 
 
153 aa  111  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3725  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
160 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  41.91 
 
 
160 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3562  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
159 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  34.64 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  34.87 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  37.09 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2710  acetyltransferase, gnat family  41.76 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.941065  normal  0.335469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4877  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667695  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  63.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  37.63 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0219  GCN5-related N-acetyltransferase  23.84 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  36.56 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  27.81 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2152  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 
184 aa  50.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  31.03 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2492  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  34.02 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1186  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25180  N-acetylglutamate synthase  27.55 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3831  GCN5-related N-acetyltransferase  26.11 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.108624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0406  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
176 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  33.33 
 
 
322 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0529  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0170  N-acetylglutamate synthase  33.78 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0541  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0519  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.971308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1675  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  26.73 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  27.78 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1774  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2930  acetyltransferase  35.37 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  27 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  28.43 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0334  N-acetylglutamate synthase  33.77 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>