152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2152 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2152  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
184 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2492  GCN5-related N-acetyltransferase  91.85 
 
 
184 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0406  GCN5-related N-acetyltransferase  65.5 
 
 
176 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0523  GCN5-related N-acetyltransferase  63.48 
 
 
186 aa  230  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1186  GCN5-related N-acetyltransferase  58.62 
 
 
175 aa  214  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  54.49 
 
 
169 aa  179  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5200  acetyltransferase  51.95 
 
 
180 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5563  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
183 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4352  GCN5-related N-acetyltransferase  48.7 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1699  GCN5-related N-acetyltransferase  46.11 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7207  acetyltransferase  44.38 
 
 
208 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1692  acetyltransferase  46.47 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1679  acetyltransferase  46.47 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1887  acetyltransferase  46.47 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0559  acetyltransferase  46.47 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2409  acetyltransferase  46.47 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2270  acetyltransferase  46.47 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.811182  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0741  acetyltransferase  46.47 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0387  putative acetyltransferase  43.83 
 
 
182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47745  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4192  GCN5-related N-acetyltransferase  46.31 
 
 
188 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658468  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  43.71 
 
 
407 aa  127  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5878  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703036  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3939  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4427  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3859  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
188 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4359  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 
208 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4319  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
186 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2930  acetyltransferase  44.51 
 
 
170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3712  GCN5-related N-acetyltransferase  45.4 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1535  GCN5-related N-acetyltransferase  43.95 
 
 
188 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  44.2 
 
 
182 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34680  acetyltransferase (GNAT) family protein  39.75 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10134  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  44.9 
 
 
165 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289647  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0403  putative acetyltransferase  42.86 
 
 
175 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0695  GCN5-related N-acetyltransferase  42.54 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0302476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34230  acetyltransferase (GNAT) family protein  35.75 
 
 
222 aa  92.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2428  GCN5-related N-acetyltransferase  39.38 
 
 
178 aa  91.3  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0529  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
164 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0541  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
164 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0519  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
164 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  35.77 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
164 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  33.58 
 
 
163 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.14 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  40.45 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.762819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5914  GCN5-related N-acetyltransferase  36.7 
 
 
167 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5984  GCN5-related N-acetyltransferase  33.86 
 
 
171 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.79 
 
 
291 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  32.85 
 
 
149 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  39.44 
 
 
152 aa  58.9  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
149 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.108624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  38.27 
 
 
322 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
153 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
157 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
291 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  32.56 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
151 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
157 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
167 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3687  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 
170 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
160 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5807  hypothetical protein  29.37 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  35.79 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  34.44 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.76 
 
 
294 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.14 
 
 
289 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0219  GCN5-related N-acetyltransferase  26.12 
 
 
152 aa  52.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2953  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
343 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  30.43 
 
 
161 aa  52  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  30.33 
 
 
290 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  30.6 
 
 
164 aa  51.2  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  24.81 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  24.81 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  36.14 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 
151 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  24.81 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
166 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
151 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  38.2 
 
 
151 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>