194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0328 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
151 aa  316  6e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  99.34 
 
 
151 aa  314  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  94.7 
 
 
151 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  94.04 
 
 
151 aa  299  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  92.72 
 
 
155 aa  296  7e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  91.39 
 
 
151 aa  290  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  90.73 
 
 
163 aa  288  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  89.4 
 
 
158 aa  287  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  89.4 
 
 
151 aa  287  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  61.59 
 
 
151 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  59.6 
 
 
151 aa  191  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  61.49 
 
 
152 aa  191  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  60.81 
 
 
151 aa  191  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  56.95 
 
 
153 aa  180  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  56.29 
 
 
151 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  55.63 
 
 
152 aa  176  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  55.7 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  54.05 
 
 
156 aa  168  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  52.32 
 
 
151 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  52.32 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  55.41 
 
 
156 aa  161  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  61.43 
 
 
141 aa  160  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2831  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 
155 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.088011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  49.01 
 
 
167 aa  158  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  50.99 
 
 
153 aa  158  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2707  acetyltransferase, GNAT family  50 
 
 
159 aa  153  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.343718  normal  0.29302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1249  acetyltransferase  50 
 
 
159 aa  153  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348752  normal  0.648372 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1714  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 
159 aa  152  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.493786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  51.03 
 
 
157 aa  151  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  50.34 
 
 
156 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  47.89 
 
 
153 aa  134  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  50.99 
 
 
157 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  44.89 
 
 
177 aa  130  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0459  GCN5-related N-acetyltransferase  45.27 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.359836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3562  GCN5-related N-acetyltransferase  46.48 
 
 
162 aa  126  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3725  GCN5-related N-acetyltransferase  41.5 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  44.6 
 
 
160 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 
159 aa  104  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2710  acetyltransferase, gnat family  50 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.941065  normal  0.335469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4877  GCN5-related N-acetyltransferase  44.29 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667695  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  35.92 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  32.24 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  36.57 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  43.01 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0335  acetyltransferase  40.58 
 
 
184 aa  53.5  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.793507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
158 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 
160 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.92 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0455  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0387  putative acetyltransferase  31.62 
 
 
182 aa  50.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47745  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2152  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0587  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.29 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.29 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.03 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3831  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2492  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
184 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1186  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3859  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
188 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0938  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.04 
 
 
176 aa  47  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4192  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
188 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658468  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  37.04 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1699  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3939  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4427  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0406  GCN5-related N-acetyltransferase  41.49 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0741  acetyltransferase  29.27 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.296931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.21 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1679  acetyltransferase  37.93 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1887  acetyltransferase  37.93 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 
407 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4319  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>