241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0189 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
159 aa  322  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  40.52 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  42.95 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  44.97 
 
 
153 aa  120  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  39.87 
 
 
163 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
156 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  45.32 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  42.76 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  40.79 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  38.93 
 
 
151 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  42.34 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
152 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  42.54 
 
 
151 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 
151 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  38.93 
 
 
151 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 
151 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  38.82 
 
 
151 aa  104  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  38.26 
 
 
151 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
160 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  45.07 
 
 
141 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
156 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  41.61 
 
 
153 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  36.91 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  42.58 
 
 
157 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2831  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.088011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  34.23 
 
 
151 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  34.69 
 
 
153 aa  87.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3562  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 
162 aa  84  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  37.32 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2707  acetyltransferase, GNAT family  31.97 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.343718  normal  0.29302 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0459  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.359836  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 
152 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1249  acetyltransferase  31.97 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348752  normal  0.648372 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1714  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.493786  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  44.26 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  36.97 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3725  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  42.71 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  41.41 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  42.16 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  36.79 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  43.62 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  40.45 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  37.4 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  37.62 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
291 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5984  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
171 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10390  acetyltransferase  35.64 
 
 
179 aa  61.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  40.66 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  43 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.108624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5914  GCN5-related N-acetyltransferase  39.18 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  39.56 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4346  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 
407 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  39.18 
 
 
290 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.86 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4877  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
153 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667695  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  30.85 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42.68 
 
 
289 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  28.17 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3939  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
188 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4427  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
188 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.71 
 
 
158 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1150  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.71 
 
 
158 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.372343  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3859  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
188 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1167  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.71 
 
 
158 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.508689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
171 aa  51.2  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127294  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
167 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5878  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
188 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703036  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  29.33 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>