277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2998 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
152 aa  308  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  59.18 
 
 
159 aa  177  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 
160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  48.2 
 
 
162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
170 aa  134  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  44.59 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  45.95 
 
 
152 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  46.31 
 
 
152 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  43.05 
 
 
158 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  44.37 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  40.67 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  44.37 
 
 
166 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  39.47 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  54.08 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
149 aa  84  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.108624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  38.28 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  45.54 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  47.32 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  42.54 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  42.62 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2953  GCN5-related N-acetyltransferase  46.08 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  33.55 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  40.78 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  42.48 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  33.56 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5984  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  32.21 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  31.33 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
159 aa  67  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  31.79 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  31.13 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3831  GCN5-related N-acetyltransferase  40.22 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  37.6 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
291 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  30 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  53.73 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.762819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3562  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3725  GCN5-related N-acetyltransferase  37.4 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  37.75 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3687  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0219  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  35.79 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.14 
 
 
289 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  39.56 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2831  GCN5-related N-acetyltransferase  38.21 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.088011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.11 
 
 
291 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4192  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
188 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658468  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  36.94 
 
 
373 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0403  putative acetyltransferase  39.58 
 
 
175 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1612  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 
169 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122446  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  30.92 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4319  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 
186 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3859  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 
188 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.11 
 
 
291 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1535  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 
188 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  34.74 
 
 
290 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4352  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5807  hypothetical protein  47.69 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0054  acetyltransferase  25.34 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5878  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703036  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3939  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4427  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>