More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1774 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1473  GCN5-related N-acetyltransferase  79.05 
 
 
150 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211829  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  78.38 
 
 
150 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  66.91 
 
 
147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164385  normal  0.0598732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1429  GCN5-related N-acetyltransferase  63.31 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.097269  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  58.21 
 
 
141 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2448  GCN5-related N-acetyltransferase  47.24 
 
 
140 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  48.03 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.08 
 
 
285 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  45.39 
 
 
287 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
146 aa  114  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  45.95 
 
 
287 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4351  GCN5-related N-acetyltransferase  51.88 
 
 
145 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.620863 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  51.64 
 
 
139 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  51.06 
 
 
146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4334  GCN5-related N-acetyltransferase  48.25 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2404  GCN5-related N-acetyltransferase  47.41 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0613463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  52.07 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688065  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3362  acetyltransferase, GNAT family  46.67 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000707749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  55.47 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4202  GCN5-related N-acetyltransferase  47.92 
 
 
143 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  47.26 
 
 
286 aa  110  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06024  acetyltransferase  42.62 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  47.55 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744506  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1920  GCN5-related N-acetyltransferase  49.64 
 
 
148 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.391479 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6182  GCN5-related N-acetyltransferase  49.64 
 
 
148 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  49.64 
 
 
148 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3600  GCN5-related N-acetyltransferase  45.52 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189095  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5197  GCN5-related N-acetyltransferase  49.29 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.24 
 
 
289 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1915  putative acetyltransferase  41.35 
 
 
141 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1383  acyltransferase-like protein  49.18 
 
 
170 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569267  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0440  GCN5-related N-acetyltransferase  47.46 
 
 
168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
287 aa  107  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
287 aa  107  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2285  acetyltransferase  46.04 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0739487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1920  acetyltransferase  46.04 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1429  acetyltransferase  46.04 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.993913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1193  acetyltransferase  46.04 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3384  acetyltransferase  46.04 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.690506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2324  acetyltransferase  46.04 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3623  GCN5-related N-acetyltransferase  42.96 
 
 
142 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal  0.813134 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2447  acetyltransferase  46.04 
 
 
151 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.657539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
140 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal  0.0182622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  47.48 
 
 
146 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1806  GCN5-related N-acetyltransferase  48.92 
 
 
146 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  47.1 
 
 
288 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2150  acetyltransferase  46.76 
 
 
213 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30090  putative acetyl transferase  41.79 
 
 
141 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1295  GCN5-related N-acetyltransferase  45.65 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1805  GCN5-related N-acetyltransferase  44.19 
 
 
156 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.0000000131755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  45.08 
 
 
138 aa  99  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2576  putative acetyl transferase  41.79 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  42.75 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1275  hypothetical protein  52.46 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  39.73 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1766  GCN5-related N-acetyltransferase  48.82 
 
 
322 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  43.06 
 
 
289 aa  93.6  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4018  acetyltransferase  43.7 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565073  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1815  GCN5-related N-acetyltransferase  43.7 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.188952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  43.7 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  37.68 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.595635 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  41.35 
 
 
162 aa  92  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158391  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28400  GCN5-related N-acetyltransferase  41.79 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0049  GCN5-related N-acetyltransferase  45.24 
 
 
138 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10100  predicted acyltransferase  44.35 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.374622  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  40.41 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1127  acetyltransferase  41.18 
 
 
138 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2788  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
138 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349423  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1330  GCN5-related N-acetyltransferase  41.22 
 
 
146 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0879736  normal  0.150143 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  38.13 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00122389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  38.13 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00477349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1673  acyltransferase-like  33.33 
 
 
320 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0919  GCN5-related N-acetyltransferase  46.4 
 
 
145 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.441761  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2995  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 
140 aa  84  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0637  acetyltransferase  35.25 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000598553  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1624  acetyltransferase  38.46 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2400  GCN5-related protein N-acetyltransferase  42.04 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376684 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2599  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2986  acetyltransferase, GNAT family  37.59 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0143175  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  42.75 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2164  acetyltransferase  35.71 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0110  GCN5-related N-acetyltransferase  43.17 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2938  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0716  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.795595  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0688  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2004  acetyltransferase  41.18 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000354216  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1085  GCN5-related N-acetyltransferase  43.18 
 
 
168 aa  77  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  41.35 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2142  acetyltransferase  36.15 
 
 
149 aa  77  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000170191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0280  GCN5-related N-acetyltransferase  38.81 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0161  acetyltransferase  36.43 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1748  acetyltransferase  39.68 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2448  acetyltransferase  39.55 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0561  acetyltransferase  39.55 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2833  acetyltransferase  39.55 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1771  acetyltransferase  39.55 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>