More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1473 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1473  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 150 aa  303  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211829  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  97.33 
 
 		 150 aa  267  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  79.05 
 
 		 148 aa  238  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  72.06 
 
 		 147 aa  193  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164385  normal  0.0598732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1429  GCN5-related N-acetyltransferase  69.85 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.097269  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  60.61 
 
 		 141 aa  156  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0440  GCN5-related N-acetyltransferase  49.26 
 
 		 168 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  47.06 
 
 		 287 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2448  GCN5-related N-acetyltransferase  49.61 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  49.63 
 
 		 287 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3362  acetyltransferase, GNAT family  49.25 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000707749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  57.36 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1383  acyltransferase-like protein  51.22 
 
 		 170 aa  116  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2404  GCN5-related N-acetyltransferase  49.25 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0613463 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1915  putative acetyltransferase  44.8 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3623  GCN5-related N-acetyltransferase  47.41 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal  0.813134 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4351  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 145 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.620863 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  50.39 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30090  putative acetyl transferase  47.01 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06024  acetyltransferase  42.86 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  47.01 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal  0.0182622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.59 
 
 		 285 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2576  putative acetyl transferase  47.01 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  52.89 
 
 		 298 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688065  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3600  GCN5-related N-acetyltransferase  47.01 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  50.37 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  44.74 
 
 		 292 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  48 
 
 		 286 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6182  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1920  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391479 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 		 287 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 		 287 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4202  GCN5-related N-acetyltransferase  47.14 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.24 
 
 		 289 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4334  GCN5-related N-acetyltransferase  46.43 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4018  acetyltransferase  45.19 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565073  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1815  GCN5-related N-acetyltransferase  45.19 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.188952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  45.52 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5197  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1805  GCN5-related N-acetyltransferase  44.27 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.0000000131755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28400  GCN5-related N-acetyltransferase  45.93 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  44.2 
 
 		 288 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  46.43 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2285  acetyltransferase  47.76 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0739487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1193  acetyltransferase  47.76 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1429  acetyltransferase  47.76 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.993913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1920  acetyltransferase  47.76 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2447  acetyltransferase  47.76 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.657539  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3384  acetyltransferase  47.76 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.690506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2324  acetyltransferase  47.76 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1766  GCN5-related N-acetyltransferase  49.25 
 
 		 322 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  43.51 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  42.75 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  43.8 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1806  GCN5-related N-acetyltransferase  47.76 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  47.76 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1295  GCN5-related N-acetyltransferase  46.43 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0049  GCN5-related N-acetyltransferase  46.83 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  43.94 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2150  acetyltransferase  47.76 
 
 		 213 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  44.27 
 
 		 289 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1127  acetyltransferase  44.78 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2788  GCN5-related N-acetyltransferase  44.78 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158391  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2995  GCN5-related N-acetyltransferase  46.4 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.595635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1275  hypothetical protein  48.36 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  43.57 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00477349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00122389  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2400  GCN5-related protein N-acetyltransferase  44.22 
 
 		 161 aa  91.3  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1624  acetyltransferase  40 
 
 		 161 aa  90.1  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2986  acetyltransferase, GNAT family  45.6 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0143175  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2599  GCN5-related N-acetyltransferase  45.6 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1330  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0879736  normal  0.150143 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  44.17 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10100  predicted acyltransferase  43.55 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.374622  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  40.6 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0919  GCN5-related N-acetyltransferase  44.93 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.441761  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0637  acetyltransferase  35.51 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000598553  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0161  acetyltransferase  37.88 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  43.28 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.268987  normal  0.639753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1673  acyltransferase-like  34.31 
 
 		 320 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2142  acetyltransferase  38.17 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000170191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0280  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2943  GCN5-related N-acetyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0716  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.795595  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0688  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3245  GCN5-related N-acetyltransferase  40.15 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380354  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0718  GCN5-related N-acetyltransferase  38.58 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  40.48 
 
 		 521 aa  77.8  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02374  putative Glr3403 protein  30.47 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0013  GCN5-related N-acetyltransferase  42.19 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2938  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1085  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2802  acetyltransferase, GNAT family  36.09 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>