More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2382 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 
289 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  65.49 
 
 
285 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  62.72 
 
 
292 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  61.84 
 
 
286 aa  359  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  60.78 
 
 
287 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  59.15 
 
 
287 aa  340  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  58.8 
 
 
287 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  58.39 
 
 
288 aa  334  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  58.06 
 
 
289 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  54.77 
 
 
287 aa  315  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  56.82 
 
 
138 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  52.86 
 
 
149 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
149 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
149 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.55 
 
 
145 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.83 
 
 
145 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 
148 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  46.32 
 
 
154 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  45.77 
 
 
154 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6182  GCN5-related N-acetyltransferase  47.55 
 
 
148 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1920  GCN5-related N-acetyltransferase  47.55 
 
 
148 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.391479 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  47.55 
 
 
148 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  43.24 
 
 
148 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5197  GCN5-related N-acetyltransferase  47.26 
 
 
146 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 
147 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164385  normal  0.0598732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  44.37 
 
 
143 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4202  GCN5-related N-acetyltransferase  44.37 
 
 
143 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1429  GCN5-related N-acetyltransferase  44.37 
 
 
142 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.097269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4334  GCN5-related N-acetyltransferase  44.37 
 
 
143 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  46.53 
 
 
146 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1383  acyltransferase-like protein  45.11 
 
 
170 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569267  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1193  acetyltransferase  45.52 
 
 
146 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1429  acetyltransferase  45.52 
 
 
146 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.993913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3384  acetyltransferase  45.52 
 
 
146 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.690506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2447  acetyltransferase  45.52 
 
 
151 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.657539  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2324  acetyltransferase  45.52 
 
 
146 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428752  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2285  acetyltransferase  45.52 
 
 
146 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0739487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1920  acetyltransferase  45.52 
 
 
146 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1806  GCN5-related N-acetyltransferase  43.36 
 
 
146 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  43.36 
 
 
146 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  46.32 
 
 
141 aa  96.3  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4351  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 
145 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.620863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
141 aa  95.5  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
146 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3600  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
141 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189095  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2448  GCN5-related N-acetyltransferase  42.03 
 
 
140 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2150  acetyltransferase  45.52 
 
 
213 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0440  GCN5-related N-acetyltransferase  40.43 
 
 
168 aa  94  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  48 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688065  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3623  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
142 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal  0.813134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  43.92 
 
 
150 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  40.69 
 
 
144 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4018  acetyltransferase  40 
 
 
142 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565073  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1815  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
142 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.188952 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
146 aa  89  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.97 
 
 
141 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  41.41 
 
 
162 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158391  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1473  GCN5-related N-acetyltransferase  43.24 
 
 
150 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211829  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
159 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.595635 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06024  acetyltransferase  41.41 
 
 
141 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1766  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
322 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1915  putative acetyltransferase  40.62 
 
 
141 aa  86.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28400  GCN5-related N-acetyltransferase  39.44 
 
 
141 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2823  acetyltransferase  38.35 
 
 
144 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000798429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2522  acetyltransferase  38.35 
 
 
144 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0369491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
140 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal  0.0182622 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  38.41 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00477349  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1805  GCN5-related N-acetyltransferase  39.73 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.0000000131755 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  38.41 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00122389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3362  acetyltransferase, GNAT family  38.73 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000707749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2603  acetyltransferase  37.59 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2792  acetyltransferase  37.59 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.7554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2576  putative acetyl transferase  38.73 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2404  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0613463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30090  putative acetyl transferase  38.73 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.88 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1295  GCN5-related N-acetyltransferase  42.36 
 
 
164 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2597  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 
144 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00223569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2555  acetyltransferase  36.84 
 
 
144 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0530574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2799  acetyltransferase, GNAT family  36.84 
 
 
144 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2995  GCN5-related N-acetyltransferase  40.94 
 
 
140 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02374  putative Glr3403 protein  35.43 
 
 
152 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2844  acetyltransferase, GNAT family  36.84 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0189947  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.65 
 
 
145 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0110  GCN5-related N-acetyltransferase  41.01 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0919  GCN5-related N-acetyltransferase  47.2 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.441761  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376684 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2802  acetyltransferase, GNAT family  36.84 
 
 
144 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283335  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 
135 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
145 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0988  acetyltransferase  41.27 
 
 
144 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0199888  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2400  GCN5-related protein N-acetyltransferase  42.86 
 
 
161 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 
152 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0280  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
155 aa  77  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0637  acetyltransferase  32.09 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000598553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2599  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1308  acetyltransferase, GNAT family  38.28 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000157971 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1240  acetyltransferase  38.28 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.797535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>